工程索赔证据主要有：合同文件、施工资料、工程照片、财务报表、政策文件等，在进行工程索赔的相关情况认定时，当事人可以向司法机关提供上述文件或者证明性材料，可以有效的对工程事故进行证明。
一、工程索赔证据怎么搜集?
1、合同文件。包括合同文本及其附件、合同补充协议、招标文件及其澄清文件、投标报价文件、中标通知书、合同图纸、工程量清单、技术规范等。
2、施工过程资料文件、会议纪要及来往函件。包括工程报建报监资料、试(检)验报告、施工管理记录、施工进度计划及进度修改计划、施工过程记录、检验批、分项、分部质量验收记录、竣工验收资料、现场气象记录、材料进场记录、人员设备安排计划和实际记录、各类工程会议纪要、施工单位与业主、监理单位的往来函件等。
3、工程照片、录像。包括工程进度照片录像、隐蔽工程覆盖前的照片录像、工程损坏的照片录像、返工的照片录像等。
4、财务会计核算资料、报表及往来凭证。包括工程款收款凭证、索赔款月报表、工人工资表、材料设备采购单等。
5、市场行情资料。包括官方公布的工程信息价、生产单位发布的产品市场价格、中央银行公布的外汇汇率等资料。
6、政策法规文件。指工程所在地适用的法律及工程所在地政府发布的对工程有影响的政府文件。
二、索赔程序
(1)索赔事件发生后28d内，向监理工程师发出索赔意向通知。
(2)发出索赔意向通知后的28d内，向监理工程师提交补偿经济损失和(或)延长工期的索赔报告及有关资料。
(3)监理工程师在收到承包人送交的索赔报告和有关资料后，于28d内给予答复。
(4)监理工程师在收到承包人送交的索赔报告和有关资料后，28d内未予答复或未对承包人作进一步要求，视为该项索赔已经认可。
(5)当该索赔事件持续进行时，承包人应当阶段性向监理工程师发出索赔意向通知。在索赔事件终了后28d内，向监理工程师提供索赔的有关资料和最终索赔报告。
工程索赔一般发生工程质量出现问题，或者未能按照约定的时间完成工程的情况下，由于在施工之前一般都是需要签订施工合同的，所以在出现相关情况后中，可以依据施工合同中的相关规定进行处理，特别是违约金的支付上应当遵照执行。